淨化無塵車間工程項目施工完成後，通常要進行一系列的檢測，以判斷淨化無塵車間工程是否合格。潔淨度是淨化無塵車間工程項目檢測中，特别核心的指标，淨化無塵車間工程潔淨度檢測的方法是：對淨化無塵車間工程進行采樣，使用激光塵埃粒子計數器進行數據檢測，依照淨化等級标準核定數據，以此判斷淨化無塵車間工程的潔淨度是否合格。

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   淨化無塵車間工程的先期設計不合理，是保證淨化無塵車間工程潔淨度達标的重要因素，合理的設計可以使工程在達标的情況下節省不必要的成本。常見的設計問題有：工程分區模糊，即高潔淨度空間與低潔淨度空間沒有合理分區；沒有合理規避障礙物，緻使障礙物造成渦流現象，影響潔淨度；人員走動路線規劃不合理，造成了人員攜帶粉塵的大面積污染。
   偷工減料這種現象常見于低級别淨化無塵車間工程，一些施工方為了獲取工程惡意競争，刻意将工程報價調低，在施工過程中偷工減料，以次充好，使用較低功率的淨化設備，緻使淨化面積與實際施工面積不符，降低潔淨度，導緻淨化無塵車間工程不合格。

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   此外，也有一些低檔淨化設備來替代高等級的淨化設備情況，例如萬級的淨化車間僅采用亞高能效空氣過濾器代替高能效空氣過濾器，導緻潔淨度不達标。劣質施工無塵車間工程，在驗收時，當發現同一系統中的某個房間或者局部潔淨度不合格，大概率是送風管或者過濾器的密封問題。施工時，要精細密封送風管和過濾器，粗制濫造的施工無法保證各個細節的施工水準，導緻送風管與過濾器的洩露。
   調試問題是淨化無塵車間工程的重要環節，編筐編簍全在收口，在淨化無塵車間工程施工完畢後，要進行全部的調試，這裡還要特别注意回風口的調試，回風口阻力過大，回風量小于送風量會造成潔淨度不合格。